1-العلم الالهي
حفظ الامام عليه السلام القرآن الكريم وادرك معانيه وفهم خفاياه وعلم حقائقه وتدبر بالنظر والتأمل والتفكير في الكون وما حواه وما حث عليه القرآن الكريم في آيات عديدة وهو ما يسمى بالمورائيات وموضوعات تتعلق بالله والثواب والعقاب وصفات الله وغيرها..
2-الفقه
كان للامام عليه السلام قدرة عجائبية لاستنباط الاحكام الشرعية وتوضيح التشريعات والنظر في المستجدات ،كان له في الفقه مواقف رائدة جعلته متفوقا على كل الناس .
3 – التفسير
اجتهد المسلمون الى معرفة ما غمض من امور الوحي والتنزيل فنشأ علم جديد هو علم التفسير.وعلي عليه السلام سيد هذا العلم فكان يرى الاحداث ويسمع الآيات ويعرف مناسبات نزولها وقد قال عليه السلام : " ما من آية نزلت الا وقد علمت فيم نزلت ،واين نزلت ،وعلى من نزلت ".وقد رويت العديد من التفسير بالاستناد الى تلميذ الامام عليه السلام عبدالله بن عباس .
4-علوم اللغة
وجد الامام علي عليه السلام المسلمون من غير العرب حديثو عهد باللغة العربية ففشا فيهم اللحن ووقعت الشبهات في قراءة القرآن الكريم فاستدعى الامام ابا الاسود الدؤلي احد علماء العصر ووضع له اسس العربية بما قدمه له من مفاهيم ومصطلحات اولية مثل الكلمة ثلاثة اقسام اسم وفعل وحرف الكلمة نكرة ومعرفة ومثل الاعراب رفع ونصب وجر وجزم ....الى آخره .
5-الزهد
كان الامام يساوي نفسه بالفقراء في كل تصرفاته مع انه خليفة المسلمين في حين كان معظم الصحابة يبنون القصور والدور ويملكون الاملاك الشاسعة وتعد ثرواتهم بمئات الآلاف من الدنانير مما اثار عامة المسلمين فكانت الفتنة الاولى في الاسلام .
6-الكرم
لم يعرف عن علي عليه السلام انه رد سائلا ،بل كان ينفق بالليل والنهار سرا وعلانية وقد وردت في حقه آيات كثيرة .
7-الشجاعة
روي عن شجاعة الامام النادرة وبطولاته التي قل مثيلها
8-الحلم
يتمثل حلم الامام في قوله :" اذا قدرت على عدوك فاجعل العفو عنه شكرا للقدرة عليه". وقد اوصى جنده الا يطاردوا هاربا ولا يجهزوا على جريح ولا يقتلوا اسيرا فلم يعامل اعداءه معاملة الخصوم بل عفا عنهم جميعا.
9-العدل
العدل من اولى الصفات التي يجب ان يتحلى بها الحاكم التي تؤهله للقيادة. وقد كان الام عليه السلام صاحب عداله ما شهد الزمن بمثلها لغيره.
10- العبادة
كان الامام عليه السلام حافظا للقرآن يتلوه ويتبصر باحكامه وبه يسوس الناس فلم يكن من هو اعمق منه ايمانا ولا اكثر تعبدا وهو الذي كانت عبادته عن يقين واكتناه اسرار الغيب.
11- البشاشة
فهو صاحب خلق كريم عليه السلام .فكان يواسي الناس ويسعدهم بالكلمة الحلوة والبسمة المشرقة والفكاهة اللطيفة.
12- الرأي والحكمة
عرف عن الامام رأيه انه لا تصلح الرعية الا بصلاح الراعي .
كما كان يدعو الى تغليب العقل على الهوى وسيطرة الفكر على اللسان وعدم الانجراف للعاطفة فتورد الانسان موارد الهلكة.
كما نهى عن سوء الظن والغيبة وسوء الكلام .
ودعا الى التأمل وعدم الخوض في الشكوك .
13- صفات اخرى
اجتمع بالامام اشفاق الاب الرؤوف ورحمة الراعي
وود الصديق اضافة الى الجد والوقار وصلابة الموقف .